В 2009 году Горьковской магистралью были выполнены следующие мероприятия по природоохранной деятельности и снижению техногенной нагрузки на окружающую среду:
• Завершено строительство очистных сооружений на станции Балезино;
• В Агрызе мазутная котельная заменена газовой;
• На электроотопление переведены котельные на станциях , Шахунья, Урень, Кстово, Вязники, Сергач и др. помещениях, принадлежащих ГЖД;
• Ликвидирована котельная на станции Киров;
• Установлено и отремонтировано пыле-газоулавливающее оборудование в ряде депо.
По результатам проведенных мероприятий выброс загрязняющих веществ в атмосферу был снижен на 3 тыс. тонн по сравнению с 2008 годом.